創辦高中部是南京漢開書院辦學的頂層設計。書院通過建立高層次人才引進和培養機制，凝聚了一支學科能力強、人文素養高、教育教學能力突出的高素質教師團隊。其中享受國務院特殊津貼專家1人，特級教師3人，正高級教師3人，大市學科帶頭人及教學能手11人，區級學科帶頭人教學能手20人。
招生條件：
(1)具有原市區(共有七區：玄武區、秦淮區、建鄴區、鼓樓區、棲霞區、雨花區、 江北新區直管區)、浦口區和六合區戶籍的初三畢業生。
(2)非南京戶籍但有南京學籍的初三畢業生。
(3)外省、市的學生需在當地取得高中學籍后，經書院考核通過后方可申請。
收費標準：
以市規劃局、物價局公布5萬/學期為準
辦學特色：
01系統化育人模式
借助書院十二年一貫制的教育體制優勢，系統化設計育人模式，打通課程體系結構，優化課程設計系統，形成漢開“系統進階營養課程”。
02豐富性課程體系
(1)普通高中課程體系
(2)漢開課程體系(高端學術課程、領導力課程、英語特色選修課程)
(3)漢開成長主題課程體系(漢開工具、漢開講堂、學長課程、社團課程、項目制學習課程)
(4)數理特色課程
03選擇性成長方式
根據學生個體能力基礎、學科基礎與升學需求，書院會提供適合學生個體成長的方式。學生可以按需選學(內容、進度、方式)，學生個體也可以發起課程，書院按需施教。教育教學可以按需定制，提優補弱，實現增值。書院可以供給學生選擇性成長的學術教育和藝體教育。
04書院式管理模式
(1)在生活管理上書院高中部實行寄宿制，目的是更好地培養學生的獨立自主能力。
(2)在班級管理上實行“導師制”“一生一策”制，導師既是學科教學者，也是學生生涯規劃與人格發展的導師。
(3)在學業管理上建立“學分制”“積分制”，注重“滴灌制”教學，促進學生不斷成長，教師坐班制，每天晚上都會有教師值班輔導的。
(4)在習慣管理上在借助漢開八大成長工具——《追光記》《班級日志》《效能手冊》《“致良知”手冊》《漢開匯》《0.5錦囊卡》《成長檔案》《我的漢開足跡》培養學生良習，幫助學生不斷登階，不斷自我實現。
(5)在生涯規劃上借助于特色課程體系，結合學生特點和需求，建立科學適切、內涵豐富、三年一貫的學生發展指導工作課程體系。開展多元主題活動，創新活動方式，通過知識講座、情景模擬、案例探討、知識應用等能力，要求學生做好自我規劃、應用科學評價系統。利用信息技術與網絡資源對學生的人格特質、興趣偏好、職業傾向等進行診斷評估，指導學生認識自我以及職業發展傾向，實現智能化、科學化指導。
05漢開心理學基礎
積極心理學
